Vladimir Poroikov » Публикация

Аннотация Семейство пептидных рецепторов, сопряженных с G-белками, а также их лигандов - эндогенных пептидов - вовлечено в регуляцию многих важных физиологических процессов в организме, вследствие чего они являются привлекательными мишенями для фармакологических исследований и конструирования лекарств (drug design). В связи с завершением черновой расшифровки генома человека стало возможным получение исчерпывающей картины всех генов, кодирующих как пептидные рецепторы, так и соответствующие им пептиды. С применением стандартных методов биоинформатики (поиск по гомологии, кластерный анализ, построение профилей и т.п.) предпринята попытка идентификации всех пептидных рецепторов, сопряженных с G-белками, и их лигандов в геноме человека. В результате проведенного исследования мы показали, что вероятное количество пептидных рецепторов в геноме человека составляет 218, а пептидов (пептидных предшественников) - 126 последовательностей. Идентифицировано 12 новых потенциальных пептидных рецепторов, сопряженных с G-белками, и 10 новых пептидных предшественников. По гомологии с известными последовательностями нами определена их вероятная функция. Проведена классификация всех вероятных пептидных рецепторов на основе их лигандной специфичности. Обсуждается лиганд-рецепторное соответствие пептидов и их рецепторов в геноме человека.